对于制造药l物，IPA 99%用于创建、纯化和分析化合物，以及净化反应器。无论是合成氨基酸还是多肽，它都是一种质子溶剂，适用于许多多步有机反应。
IPA 99%也适用于运行实验室分析，如HPLC、GC、荧光或 TLC，以表征和量化化学品。乙l腈（一种用于反相 HPLC 和 UPLC 的常用溶剂）在全l球范围内短缺，因此科学家们开发了更多含有IPA的洗脱液系统。由于该等级经过微米过滤且不挥发物含量低，因此不需要进一步过滤。由于它受紫外线吸收率控制，因此适用于关键分析。
组织学级99% IPA不含DNases、RNases和核酸，用于制备下游分子反应的样品，如分光光度分析、凝胶电泳、限制性酶分析、核苷酸测序或用于核酸检测的聚合酶链反应。当有大量样本可用时，建议使用IPA 99%来浓缩和纯化DNA，因为它高l效且快速。将条件保持在室温并尽量减少孵育时间应该有助于防止盐沉淀。
汽车行业使用99%的IPA进行汽车护理。汽车美容师通常在喷漆或抛光之前使用IPA去除汽车上的蜡并稀释漆。由于它是一种解冻剂，它通常被添加到挡风玻璃清洗液或燃料箱中以溶解水，使其不会从气体中分离出来并在管路中冻结。
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